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第1章　药用天然产物及其研究方法1

1.1　药用天然产物1

1.1.1 历史1

1.1.2　天然产物在药物开发中的现状2

1.1.3　天然产物在药物开发中的前景5

1.2　天然产物的治疗领域7

1.2.1　感染疾病7

1.2.2　抗肿瘤药物8

1.2.3　心血管及内分泌疾病8

1.3　天然产物研究方法8

1.3.1　传统方法8

1.3.2　活性化合物的筛选新方法14

1.4　药用天然产物的反向途径16

参考文献17

第2章　天然产物的生物合成20

2.1　概述20

2.2　天然产物的生物合成途径21

2.2.1　一次代谢与二次代谢21

2.2.2　生物合成假说的提出22

2.2.3　主要的生物合成途径24

2.3　天然产物生源合成研究应用32

2.3.1　植物学领域33

2.3.2　植物化学领域36

2.3.3　生物化学与生物工程领域38

参考文献39

第3章　药用植物化学成分的提取、分离与纯化40

3.1　天然产物化学成分的提取40

3.1.1　药用天然产物经典提取方法40

3.1.2　天然产物化学成分的现代提取方法46

3.2　天然产物的分离47

3.2.1　天然产物的经典分离方法48

3.2.2　天然产物的现代分离方法61

参考文献65

第4章　天然产物化学成分分析及结构鉴定66

4.1　天然产物化学成分结构鉴定方法学66

4.1.1　核磁共振技术67

4.1.2　有机质谱71

4.1.3　其他波谱技术71

4.2　天然产物化学成分的结构鉴定72

4.2.1　萜类化合物72

4.2.2　黄酮类化合物77

4.2.3　苯丙素化合物79

4.2.4　生物碱类化合物86

4.2.5　甾体类化合物88

参考文献90

第5章　药用植物活性成分的生物转化91

5.1　概述91

5.2　药用植物萜类活性成分的生物转化93

5.2.1　紫杉醇生物转化93

5.2.2　青蒿素的生物转化98

5.2.3　其他萜类化合物的生物转化104

5.3　药用植物生物碱类活性成分的生物转化112

5.3.1　长春花生物碱的生物转化113

5.3.2　喜树碱的生物转化117

5.3.3　其他类型生物碱的生物转化120

5.4　药用植物甾体类活性化合物的生物转化121

5.4.1 甾体化合物的生物合成121

5.4.2　甾体类活性成分的生物转化122

5.5　其他类型活性成分的生物转化126

5.5.1　黄酮类化合物的生物转化126

5.5.2　蒽醌类化合物128

5.5.3　其他类型活性化合物的生物转化130

参考文献131

第6章　计算药理学在药用天然产物研究中的应用136

6.1　计算机辅助药物分子设计（CADD）136

6.1.1　计算机辅助药物分子设计方法136

6.1.2　CADD中的几个难题138

6.1.3　计算机辅助药物分子设计的前景139

6.2　构建数据库141

6.2.1　剑桥结构数据库（CSD）141

6.2.2　CrossFire Beilstein数据库142

6.2.3　MDL？代谢数据库142

6.2.4　MDL？毒性数据库143

6.2.5　NCI数据库143

6.2.6　天然产物数据库（DNP）144

6.2.7 中草药三维结构、性质数据库（CHDD）145

6.2.8 中国天然产物数据库（CNPD）145

6.3　分子对接方法147

6.3.1　分子对接方法的分类147

6.3.2　分子对接方法中的重要问题148

6.3.3　几种有代表性的分子对接方法149

6.4　定量构效关系方法研究155

6.4.1　二维定量构效关系方法155

6.4.2　三维定量构效关系方法156

6.4.3　建立定量构效关系的统计方法157

6.5　结合自由能的计算158

6.5.1 自由能计算方法159

6.5.2 自由能微扰（FEP）方法159

6.5.3　热力学积分（TI）方法160

6.5.4　线性相互作用能（LIE）方法161

6.5.5　基于MM/PBSA的自由能计算方法163

6.6 计算机辅助的化合物药代动力学特征及毒性的预测164

6.6.1　药代动力学特征的预测164

6.6.2　化合物毒性预测方法177

6.7　中草药有效成分化合物的化学空间分析185

6.7.1　介绍185

6.7.2　分子描述符的计算186

6.7.3　结果与讨论186

6.7.4　主成分分析191

6.7.5　结论191

6.8　血府逐瘀汤潜在协同作用及抑制多个靶酶的计算探讨192

6.8.1　介绍192

6.8.2　方法和预处理192

6.8.3　血府逐瘀汤组分的化学空间分析193

6.8.4　血府逐瘀汤与心血管系统靶酶的相互作用研究196

6.8.5　血府逐瘀汤药物代谢动力学性质的研究199

参考文献200

第7章　基于亲和前沿色谱-质谱联用技术的药用天然产物筛选方法202

7.1 亲和色谱及前沿色谱介绍202

7.1.1　亲和色谱202

7.1.2　亲和前沿色谱203

7.2　亲和前沿色谱-质谱联用205

7.2.1　原理与装置205

7.2.2　FAC-MS的应用206

7.2.3 总结与展望212

7.3 阻断SARS侵入细胞的抑制剂的固定化酶亲和前沿色谱-质谱联用法直接筛选214

7.3.1 严重急性呼吸道综合症病毒（SARS-CoV）214

7.3.2　阻断SARS侵入细胞的抑制剂的筛选216

7.3.3　小结219

7.4 固定化多克隆抗体亲和前沿色谱-质谱联用法直接筛选220

7.4.1 多克隆抗体的应用背景220

7.4.2 固定化多克隆抗体亲和前沿色谱-质谱联用法直接从鬼箭锦鸡儿中筛选EGFR抑制剂225

7.4.3 抗EGFR药物的初步筛选232

7.4.4 多克隆抗体的制备233

7.4.5 多克隆抗体的纯化及其性质评价235

7.4.6 多克隆抗体的固定化与亲和前沿色谱238

7.4.7 多克隆抗体识别鬼箭锦鸡儿中活性成分239

7.4.8 小结242

参考文献242

第8章 药用天然产物的筛选与分离一体化技术245

8.1 分子烙印聚合物介绍245

8.1.1 方法起源及概述245

8.1.2 分子烙印聚合物的制备方法246

8.1.3 分子印迹机理研究258

8.1.4 分子烙印聚合物的应用范围260

8.2 分子烙印聚合物的应用260

8.2.1 固相萃取260

8.2.2 液相色谱262

8.2.3 传感器263

8.2.4 模拟抗体264

8.2.5 模拟酶催化265

8.3 分子烙印固相萃取中药中特定药效组分——黄酮类265

8.3.1　聚合物的制备265

8.3.2　聚合物的选择性评价266

8.3.3　聚合物固相萃取柱柱载量测定268

8.3.4 固相萃取分离银杏叶中黄酮类药效成分269

8.3.5　萃取分离沙棘草药粗提物中特定药效黄酮组分270

8.4　分子烙印亲和分离在线鉴定中草药中有效成分272

8.4.1　仪器和材料272

8.4.2　聚合物制备273

8.4.3　液相色谱评价聚合物对目标分子的选择性274

8.4.4　前沿色谱方法测量结合位点数及离解常数276

8.4.5　骆驼蓬样品的制备278

8.4.6　MIP-LC-MS在线分离鉴定278

8.5 分子烙印识别中药中抗表皮生长因子受体（EGFR）的活性成分283

8.5.1 聚合物制备283

8.5.2 藏锦鸡儿粗提物的制备284

8.5.3 槲皮素-MIP柱固相萃取藏锦鸡儿中活性成分284

8.5.4 白皮杉醇-MIP柱识别藏锦鸡儿中活性成分285

8.6 分子烙印在药物开发方面的应用前景289

参考文献290