图书介绍

常用计算机辅助药物设计软件教程【2025|PDF|Epub|mobi|kindle电子书版本百度云盘下载】

张亮仁主编著
出版社：北京：中国医药科技出版社
ISBN：9787506792158
出版时间：2017
标注页数：257页
文件大小：24MB
文件页数：264页
主题词：药物－计算机辅助设计－教材

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图书目录

第一章同源模建法预测蛋白质结构1

第一节同源模建概述1

第二节同源模建3

第二章分子对接预测结合位点18

第一节利用AutoDock进行分子对接18

第二节利用DOCK进行分子对接31

第三节利用Surflex-Dock进行分子对接46

第四节利用GOLD进行分子对接68

第三章蛋白质与核酸的分子动力学模拟99

第一节分子动力学概述99

第二节利用GROMACS进行纯蛋白分子动力学模拟100

第三节蛋白与小分子复合物的动力学模拟121

第四节核酸分子动力学模拟143

第四章利用OpenEye组件包进行虚拟筛选150

第一节软件简介150

第二节利用OpenEye组件包进行虚拟筛选152

第五章定量构效关系分析164

第一节 CoMFA＆CoMSIA164

第二节 HQSAR177

第六章药效团185

第一节药效团介绍185

第二节利用Discovery Studio进行药效团模型构建189

第七章全新药物设计207

第一节概述207

第二节利用LigBuilder进行全新药物设计209

第八章作图软件PyMOL的应用227

第一节 PyMOL简介227

第二节 PyMOL基本操作227

第九章药物设计实例241

第一节利用OpenEye发现F.tularensis烯酰基载体蛋白还原酶FabI抑制剂241

第二节基于模建结构的虚拟筛选发现对虾黄头病毒蛋白酶抑制剂245

第三节基于药效团建模和分子对接的虚拟筛选发现β-分泌酶抑制剂249

参考文献252

彩图255