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第一章 绪论1

一、什么是蛋白质1

二、蛋白质在生命体中的重要地位1

三、蛋白质的元素组成和结构组成2

四、蛋白质的分类3

五、蛋白质研究史上的重要人物和事件4

六、我国国内蛋白质研究现状5

七、当前蛋白质研究的热点和特点6

第二章 蛋白质的基本结构单位——氨基酸11

第一节 氨基酸的结构及分类11

一、常见的蛋白质氨基酸11

二、不常见的蛋白质氨基酸14

三、非蛋白质氨基酸15

第二节 氨基酸的理化性质与应用16

一、氨基酸的物理性质16

二、氨基酸的化学性质18

第三节 氨基酸的制备、分离与分析23

一、氨基酸的制备23

二、氨基酸的分离与分析24

第三章 氨基酸的连接——肽键与肽29

一、肽键和肽的基本概念29

二、肽键的结构30

三、肽的物理和化学性质31

四、生物活性肽32

五、多肽组与多肽组学33

第四章 蛋白质的表征37

第一节 蛋白质的定量37

一、紫外吸收法37

二、Folin-酚法39

三、BCA法40

四、考马斯亮蓝G-250比色法（Bradford法）42

五、利用微波快速蛋白质定量法44

第二节 蛋白质纯度的测定45

一、光谱法45

二、层析法46

三、电泳法47

四、N-末端氨基酸测定法47

五、生物活性测定法48

六、纯度测定的原则48

第三节 蛋白质相对分子质量的测定48

一、SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳测定法49

二、凝胶过滤层析法53

三、生物质谱法58

第四节 蛋白质等电点的测定62

第五章 蛋白质的分子构象68

第一节 蛋白质分子中的化学键及蛋白质一级结构68

一、蛋白质分子中的化学键68

二、蛋白质的一级结构69

第二节 蛋白质的二级结构69

一、α螺旋69

二、β折叠70

三、β转角71

四、β凸起72

五、无规卷曲72

六、超二级结构和结构域72

第三节 蛋白质的三级结构和四级结构75

一、蛋白质的三级结构75

二、蛋白质的四级结构76

第四节 蛋白质折叠异构酶和分子伴侣77

第六章 蛋白质构象解析技术策略81

第一节 蛋白质一级结构测定81

一、蛋白质序列测定的基本战略81

二、蛋白质序列测定的一般步骤81

三、测序过程中关键步骤的测定方法82

四、蛋白质序列测定的新方法——生物质谱91

第二节 蛋白质高级结构解析技术92

一、X射线晶体衍射技术93

二、核磁共振技术96

三、高级结构解析的其他方法101

第三节 蛋白质高级结构预测技术103

一、蛋白质结构预测的实验理论基础103

二、蛋白质结构预测方法105

第七章 蛋白质的结构与功能112

第一节 蛋白质结构的价值及其与功能的关系112

一、蛋白质的功能是蛋白质结构的延伸112

二、蛋白质结构是蛋白质功能的基础112

三、蛋白质的功能在与其他分子相互作用的互动中实现114

第二节 蛋白质一级结构与功能的关系114

一、活性蛋白质与前体114

二、一级结构与物种进化的关系118

三、一级结构改变与分子病120

第三节 蛋白质空间结构与功能的关系120

一、血红素辅基的结构121

二、肌红蛋白和血红蛋白的结构与功能121

第四节 蛋白质构象病及其治疗策略127

一、蛋白质构象病的概念127

二、构象病的发生、发现及蛋白质构象致病假说128

三、其他的蛋白质构象病131

四、蛋白质构象病治疗的新思路131

第八章 蛋白质的翻译后加工与修饰135

第一节 蛋白质的翻译后加工135

一、氨基端的加工135

二、蛋白质肽链的加工136

第二节 蛋白质的翻译后修饰137

一、蛋白质的磷酸化修饰137

二、蛋白质的糖基化修饰143

三、蛋白质的泛素化修饰146

四、蛋白质的乙酰化修饰148

五、蛋白质的甲基化修饰149

第九章 蛋白质的理化性质与分离鉴定152

第一节 理化性质152

一、蛋白质的酸碱性152

二、蛋白质的胶体性质152

三、蛋白质的变性、沉淀和凝固153

四、蛋白质的紫外吸收154

第二节 蛋白质的分离和纯化154

一、蛋白质分离提纯的一般步骤154

二、蛋白质分离、纯化的方法155

第十章 蛋白质组学172

第一节 蛋白质组学产生的历史背景172

一、大规模生物学的兴起172

二、从基因组、转录物组到蛋白质组173

三、蛋白质组学的基本概念及意义173

第二节 蛋白质组学的研究范畴174

第三节 蛋白质组学研究的技术策略与技术平台176

一、蛋白质组分离鉴定方法的发展176

二、蛋白质组学研究的技术策略180

三、大规模蛋白质组的制备、分离与鉴定181

第四节 蛋白质组学的应用186

一、在基础研究方面的应用186

二、在医学与药物学中的应用186

三、在农业科学研究中的应用187

第五节 蛋白质组学的挑战188

参考文献191