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1　野猪的特征与分类1

1.1　野猪的生物学特性1

1.1.1　野猪的体貌特征1

1.1.2　野猪的行为2

1.1.3　野猪的天敌2

1.2　分布2

1.2.1　原始分布范围2

1.2.2　现代分布范围3

1.3　分类4

1.3.1　古代三种名谓“猪”的动物4

1.3.2　世界猪的种类、分布和现状5

1.3.3　现代野猪的生物学分类7

1.3.4　现代野猪及其近亲资源8

1.4　野猪遗传学研究进展12

1.4.1　野猪的染色体研究12

1.4.2　野猪线粒体DNA与家猪起源、进化关系的研究12

1.4.3　野猪部分核内基因的研究15

1.5　野猪资源的开发与利用16

1.5.1　野猪与家猪杂交利用情况16

1.5.2　野猪开发利用前景19

1.6　黑龙江省野猪特征20

1.6.1　体型外貌20

1.6.2　繁育性能20

1.6.3　生长性能20

2　生物多样性21

2.1　生物多样性的概念21

2.1.1　生物多样性概念的提出21

2.1.2　生物多样性的定义22

2.1.3　生物多样性指数22

2.2 生物多样性的四个层次23

2.2.1　遗传多样性23

2.2.2　物种多样性28

2.2.3　生态系统多样性31

2.2.4　景观多样性42

2.3 中国生物多样性的一般特点42

2.3.1 物种高度丰富43

2.3.2　特有属、种繁多43

2.3.3　区系起源古老44

2.3.4　栽培植物、家养动物及其野生亲缘的种质资源异常丰富44

2.3.5　生态系统丰富多彩45

2.3.6　空间格局繁复多样性46

2.4　生物多样性的经济价值及面临的问题47

2.4.1　生物多样性的经济价值47

2.4.2　生物多样性经济价值的特点49

2.4.3　生物多样性遭受危害的原因50

2.4.4　生物多样性的丧失与其经济价值的关系52

2.4.5　生物多样性价值在空间上的流动52

2.5　保护中国生物多样性的对策53

2.5.1　正确认识生物多样性的价值，全面评价生物多样性54

2.5.2　正确处理社会经济发展与生物多样性保护的关系，调整国家政策54

2.5.3　协调部门机构间的关系，为总的保护目标而齐心协力54

2.5.4　制定统一的国家生物多样性保护纲要策略55

2.5.5　持续利用生物资源55

2.5.6　开展多种经营，综合利用土地资源55

2.5.7　就地保护野生物种及其栖息地和生态系统，加强保护区建设和管理55

2.5.8　加强重要物种及其遗传资源的迁地保护56

3　遗传多样性研究的原理与方法57

3.1　遗传标记的定义及发展历史57

3.1.1　遗传标记的定义57

3.1.2　遗传标记的发展历史58

3.2　形态标记的原理、方法与应用59

3.2.1　原理59

3.2.2　方法60

3.2.3 应用60

3.3 细胞标记的原理、方法与应用61

3.3.1 染色体核型分析原理和方法61

3.3.2　染色体显带技术原理和方法62

3.3.3 应用63

3.4　生化标记的原理、方法与应用64

3.4.1　原理64

3.4.2　方法65

3.4.3　应用65

3.5　分子标记的原理、方法及应用66

3.5.1　原理66

3.5.2　方法66

3.6　基于杂交技术的分子标记技术67

3.6.1　限制性片段长度多态性（RFLP）67

3.6.2　原位杂交（In Situ Hybridization）73

3.7　以PCR为基础的分子标记技术80

3.7.1　随机扩增多态性（RAPD）80

3.7.2　扩增片段长度多态性（AFLP）83

3.7.3　DNA指纹技术（DAF）90

3.7.4　单链构像多态性PCR（PCR-SSCP）94

3.8　以重复顺序为基础的标记技术97

3.8.1　简单序列重复标记技术97

3.8.2　简单序列重复间区标记技术（ISSR）101

4　核型和显带研究104

4.1　猪的核型和显带研究情况104

4.1.1　家猪的核型和显带研究情况104

4.1.2　野猪染色体研究106

4.2　材料与方法109

4.2.1　实验动物109

4.2.2　实验器材109

4.2.3　实验药品110

4.2.4　制备染色体标本的方法110

4.2.5　C显带技术112

4.2.6　G显带技术112

4.2.7　摄影113

4.2.8　统计分析113

4.3　结果与分析114

4.3.1 染色体标本制备的最适条件和适宜的显带方法114

4.3.2　东北野猪的核型分析结果116

4.3.3　东北野猪染色体C带、G带及高分辨G带核型117

4.4　讨论122

4.4.1 影响东北野猪及其与家猪杂种猪染色体标本制备效果的因素122

4.4.2　制备染色体高分辨G带的方法123

4.4.3　东北野猪的染色体数与核型124

4.4.4　东北野猪的染色体C带、G带和高分辨G带125

4.5　结论128

5　线粒体控制区（D-Loop）的遗传多样性129

5.1　线粒体基因组的结构及遗传特性129

5.1.1　细胞内线粒体DNA的数目和大小129

5.1.2　线粒体DNA的结构与组成129

5.1.3　线粒体基因组的遗传特性130

5.1.4　线粒体基因组与核基因组的关系132

5.1.5　线粒体DNA多样性在家猪中的应用132

5.1.6　D-Loop环的遗传多样性研究135

5.1.7　黑龙江省野猪线粒体基因组142

5.2　系统进化研究144

5.2.1　系统进化树145

5.2.2　构建系统进化树的步骤145

5.2.3　构建系统进化树的方法145

5.3　材料与方法148

5.3.1　实验材料148

5.3.2　实验方法150

5.3.3　结果与分析155

5.3.4　讨论159

5.3.5　结论164

6 黑龙江野猪的组织相容性复合体Ⅱ类基因的多态性分析165

6.1　主要组织相容性复合体（MHC）的研究进展165

6.1.1　MHC基因结构、功能、遗传特性165

6.1.2　不同物种MHC基因研究进展166

6.1.3　MHC基因在动物遗传学基础研究上的意义178

6.1.4　基因在动物育种方面的应用179

6.2　材料与方法181

6.2.1　实验材料181

6.2.2　实验方法182

6.2.3　生物信息学分析187

6.3　结果与分析188

6.3.1　黑龙江野猪的SLA-Ⅱ类基因的克隆测序结果188

6.3.2　黑龙江野猪的SLA-Ⅱ类基因的PCR-RFLP检测结果192

6.4　讨论194

6.4.1　SLA-Ⅱ类基因的表达研究194

6.4.2　SLA-Ⅱ类基因的多态性分析195

6.5　结论197

7　黑龙江野猪10个与繁殖性状相关功能基因的多态性分析199

7.1　研究背景及国内外研究进展199

7.1.1　研究背景199

7.1.2　候选基因法及QTL200

7.1.3　10个功能基因的研究概况205

7.2　材料与方法213

7.2.1　实验材料213

7.2.2　实验方法214

7.3　结果与分析216

7.3.1　雌激素受体基因的多态性检测结果216

7.3.2　卵泡刺激素β亚基基因的多态性检测结果217

7.3.3　促黄体激素基因的多态性检测结果217

7.3.4　催乳素受体基因的多态性检测结果217

7.3.5 Ⅰ型兰尼定受体基因的多态性检测结果218

7.3.6　视黄醇结合蛋白基因的多态性检测结果218

7.3.7 骨桥蛋白基因的多态性检测结果218

7.3.8　谷胱甘肽过氧化物酶5基因的多态性检测结果218

7.3.9　猪α1-岩藻糖转移酶基因的多态性检测结果219

7.3.10 核受体辅激活蛋白1基因的多态性检测结果219

7.4　讨论219

7.4.1　关于ESR,FSHβ,PRLR和FUT1基因219

7.4.2 关于GPX5,NCOA1,OPN和RBP4基因220

7.4.3　PCR-SSCP检测结果221

7.5　结论221

参考文献222