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第一章 绪论1

第一节 病原病毒的发现1

第二节 病原病毒及其本质2

第三节 植物病原病毒与病毒病害3

第四节 植物病原病毒学的内容5

第二章 植物病毒的特征7

第一节 植物病毒的形态与结构7

一、病毒的形态7

二、病毒粒体的结构9

第二节 植物病毒的化学组成12

一、病毒的核酸12

二、病毒的蛋白质13

三、病毒中的其他化学物质13

第三节 植物病毒的基因组特征14

一、单链正义RNA病毒14

二、单链负义RNA病毒17

三、双链RNA病毒18

四、单链及双链DNA病毒18

第四节 病毒编码的蛋白质种类及其功能18

一、外壳蛋白20

二、复制蛋白和复制增强蛋白20

三、与运动有关的病毒蛋白及功能22

第三章 DNA病毒的分子生物学26

第一节 双生病毒科的分子生物学26

一、双生病毒科的基因组结构26

二、双生病毒科的复制29

三、双生病毒科的转录32

第二节 矮缩病毒科的分子生物学33

第三节 花椰菜花叶病毒科的分子生物学35

一、花椰菜花叶病毒科的基因组结构36

二、花椰菜花叶病毒的复制38

第四章 RNA病毒的分子生物学43

第一节 RNA病毒基因组的组成和结构43

一、基因组组成和结构的一般特性43

二、正链RNA病毒基因组的组成和结构44

三、负链RNA基因组病毒的组成和结构69

四、双链RNA病毒基因组的组成和结构70

第二节 RNA病毒的基因表达和调控71

一、mRNA合成71

二、真核生物蛋白质合成系统73

三、植物病毒RNA表达策略73

四、植物RNA病毒使用多种策略表达基因组编码的基因79

五、植物病毒翻译过程的调控80

第三节 RNA病毒的复制83

一、RNA复制酶83

二、构成复制酶复合体的各蛋白质之间的相互作用和复制酶的组装87

三、模板识别和复制起始87

四、RNA复制从起始到延长的转换92

五、病毒RNA在细胞内膜上的复制93

六、gRNA复制与sgRNA转录的关系和调控94

七、RNA翻译（蛋白质合成）与RNA复制的调控95

八、正负链RNA的不对称合成95

第五章 植物病毒的变异、进化和起源113

第一节 植物病毒的变异114

一、植物病毒变异概述114

二、植物病毒种群的准种结构115

第二节 病毒变异的分子基础117

一、突变117

二、重组118

三、重排119

四、基因重复120

五、基因重叠121

第三节 病毒在种群中的分子进化机制122

一、分子进化的理论模型122

二、遗传漂移123

三、选择125

四、互补作用127

第四节 病毒的模块进化127

一、微观进化和宏观进化127

二、模块进化理论128

三、病毒基因组中的功能模块及其进化128

第五节 病毒的起源132

一、退化论133

二、起源于最原始的能自我复制的分子133

三、起源于寄主-细胞RNA和／或DNA组分134

第六章 植物病毒的分类与命名141

第一节 病毒分类进程141

第二节 病毒分类和命名准则143

第三节 病毒名称缩写原则145

第四节 病毒分类依据146

第五节 植物病毒分类系统147

第七章 植物病毒的分离与提纯155

第一节 病毒分离提纯的基本原理155

第二节 病毒的分离155

第三节 病毒的毒源繁殖156

第四节 病毒的提纯158

一、抽提介质的准备158

二、植物组织和细胞破碎159

三、植物病毒的粗提纯160

四、病毒的精提纯161

五、提纯病毒的保存162

第八章 植物病毒的侵染与增殖164

第一节 病毒的侵染164

一、吸附和侵入164

二、脱壳165

第二节 病毒的增殖166

一、病毒核酸的复制166

二、病毒蛋白的合成167

第三节 病毒的装配167

一、装配168

二、成熟169

第四节 病毒的扩散、运输与分布169

一、病毒在细胞间的移动169

二、病毒的长距离运输173

三、病毒在寄主体内的分布174

第九章 植物病毒与寄主植物的互作178

第一节 致病性与抗病性178

一、致病性与抗病性的类型178

二、致病性与抗病性的基础179

第二节 基因沉默及其抑制180

一、基因沉默作用180

二、基因沉默的抑制183

三、避免PTGS的其他机制185

第三节 诱导抗性和信号转导186

一、局部获得性抗性186

二、系统获得抗性与信号转导186

第四节 抗性遗传190

一、抗病毒基因191

二、病毒在初侵染细胞中复制的能力193

三、病毒从第一个细胞迁移出的能力194

四、TMV在N基因烟草中诱发的HR194

五、其他病毒—寄主过敏性反应195

第五节 病毒对寄主基因表达的调控197

一、病毒侵染对寄主细胞中核酸与蛋白质的影响197

二、发生过敏性反应的寄主中蛋白质的变化198

三、病毒侵染对寄主细胞的其他影响199

四、病毒与植物在分子水平上的互作200

第十章 类病毒、卫星病毒及卫星核酸207

第一节 类病毒207

一、类病毒的生物学特性207

二、类病毒的种类及分子结构208

三、类病毒RNA的复制与剪切加工211

四、类病毒的移动212

五、类病毒的检测与防治213

第二节 卫星病毒214

第三节 卫星核酸215

一、卫星DNA216

二、卫星RNA218

第十一章 植物病毒的诊断与检测224

第一节 生物学测定法225

一、侵染性测定225

二、指示植物测定226

三、寄主范围测定227

四、传播方式测定227

五、细胞内含体测定227

第二节 电子显微镜测定法228

一、负染色法228

二、超薄切片法229

三、免疫电镜法229

第三节 血清学测定法230

一、抗原和抗体230

二、植物病毒抗血清的制备231

三、酶联免疫吸附测定法232

四、免疫印迹法233

五、免疫试条法233

第四节 分子生物学测定法234

一、双链RNA技术234

二、核酸分子杂交234

三、多聚酶链式反应235

第十二章 植物病毒的寄主反应与寄主范围241

第一节 植物病毒病的症状241

一、症状类型241

二、局部症状和系统症状244

三、病毒病症状的复杂性244

四、病毒引起植物症状的分子机理245

第二节 植物病毒的细胞病理学246

一、寄主植物的细胞病变246

二、病毒内含体247

第三节 植物病毒的病理生理学249

第四节 植物病毒的寄主范围250

第十三章 植物病毒的传播253

第一节 病毒传播的方式253

第二节 病毒的介体传播254

一、昆虫介体256

二、线虫介体257

三、真菌介体258

四、脊椎动物传毒介体258

五、寄生性种子植物258

第三节 病原病毒介体传播的基本模式258

一、病毒介体的传毒模式259

二、介体特异性传毒的机制260

第四节 病毒介体昆虫传播的分子基础262

一、黄瓜花叶病毒属263

二、马铃薯Y病毒属263

三、花椰菜花叶病毒264

四、其他非循回式病毒265

五、黄症病毒属265

六、双生病毒267

七、其他非增殖型病毒267

八、循回式增殖型病毒268

第五节 介体线虫和真菌传播病毒的分子基础269

一、线虫传病毒269

二、真菌传病毒271

第六节 植物病毒的种子和花粉传播273

第七节 结语277

第十四章 植物病毒的生态学与流行学291

第一节 植物病毒生态学291

第二节 植物病毒流行学292

一、病毒病害流行的时间动态292

二、病害流行的空间动态293

第三节 影响植物病毒传播和流行的因素294

一、生物因子对病毒传播和流行的影响294

二、非生物因子对病毒传播和流行的影响300

第四节 植物病毒病害的流行模式和梯度301

一、流行模式301

二、病害梯度301

第十五章 植物病毒病害的管理305

第一节 病毒病害管理的基本原则305

第二节 病毒病害管理的基本途径305

一、宏观生态管理305

二、微观生态管理313

第三节 抗病毒基因工程314

一、抗病毒基因工程策略314

二、植物抗病毒基因工程的安全性319

第四节 抗病毒活性物质321